Il regolamento si applica anche ai controlli ufficiali sulle norme per il benessere degli animali, ad esempio riguardo a trasporto, macellazione e allevamento, e consente l'adozione di atti legislativi della Commissione volti ad adeguare i requisiti per i controlli ufficiali alle esigenze specifiche del benessere degli animali come l'introduzione di indicatori di benessere.
Die Verordnung gilt auch für amtliche Kontrollen zu Tierschutzvorschriften, z. B. für Transport, Schlachtung und Tierhaltung. Sie ermöglicht die Annahme von Rechtsvorschriften der Kommission, mit denen die Anforderungen an amtliche Kontrollen an die spezifischen Bedürfnisse des Tierschutzes angepasst werden können, beispielsweise durch die Einführung von Tierschutzindikatoren.