Oltre ai principi fissati all'articolo 17, la WFD determina anche le norme fondamentali per la protezione delle acque sotterranee: obiettivi ambientali specifici (articolo 4), monitoraggio dello stato delle acque sotterranee (articolo 8), divieto di scarico diretto nel contesto del programma di misure programmato (articolo 11), speciali regolamenti per "corpi idrici utilizzati per l'estrazione" di acqua potabile (articolo 7).
Neben den in Artikel 17 festgelegten Grundsätzen legt die Wasserrahmenrichtlinie ebenfalls grundlegende Anforderungen für den Grundwasserschutz fest: Spezifische Umweltziele (Artikel 4), Überwachung des Zustands des Grundwassers (Artikel 8), Verbot der direkten Einleitung im Rahmen geplanter Programmmaßnahmen (Artikel 11), Sonderbestimmungen für „Wasserkörper für die Entnahme von Trinkwasser“ (Artikel 7).